Los huevos oligolecíticos de Amphioxus pasan por una segmentación holoblástica en la que hay relativamente poca diferencia entre los blastómeros. La primera división parte el huevo a la mitad, en un plano que va del polo animal al vegetal. La siguiente división es perpendicular a esta y la tercera división llamada ecuatorial parte a cada uno de los blastómeros a la mitad en medio del polo animal y vegetal. Una serie de divisiones posteriores dan lugar al estadio de 16 y 32 blastómeros que forman la etapa de mórula. A continuación se forma una cavidad y entonces el embrión multicelular recibe el nombre de blástula. La blástula tiene un blastocele grande y central con una sola capa de células. Posteriormente el hemisferio vegetativo se invagina hasta alcanzar el germinativo dando una capa doble de células por fuera, el ectodermo y por dentro el endo y mesodermo. En ocasiones desaparece el blastocele.
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